16S rRNAと16S rDNAの主な違いは、16S rRNAが原核生物のリボソームにおけるスモールサブユニットまたは30Sサブユニットの構成要素であるのに対し、16SrDNAは16S rRNAをコードする遺伝子である点です。
さらに、16S rRNAは翻訳されるmRNA上のShine-Dalgarno配列との結合に関与し、16S rDNAは転写を受けてその遺伝子産物である16S rRNAを産生する。
また、原核生物は1つのゲノムに複数の16S rDNAの配列を持っており、16S rDNAは細菌や古細菌の異なる種の間で保存されている。
16S rRNAと16S rDNAは、原核生物に存在する2種類の塩基配列であり、一般に、原核生物は16S rRNAと16S rDNAの2種類の塩基配列を持つ。
一般に、原核生物のmRNAの翻訳を促進する役割を担っている。
主な対象分野
- 16S rRNAとは
– 定義、構造、重要性 - 16S rDNAとは
– 定義、構造、重要性 - 16S rRNAと16S rDNAの類似点とは?
– 共通点の概要 - 16S rRNAと16S rDNAの違いとは?
– 主な違いの比較
この記事の重要な単語
16S rDNA、16S rRNA、mRNA、原核生物リボソーム、rRNA、スモールサブユニット、翻訳
16S rRNAとは
16S rRNAは、原核生物のリボソームの小サブユニットを構成する役割を持つrRNAの一種です。
16S rRNAの大きさは1542 ntであることが大きな特徴です。
一般に、大サブユニットのrRNAと同様に、リボソームタンパク質の足場を決められた位置に配置する構造的な役割を担っている。
また、大サブユニット内の23S rRNAと相互作用することにより、小サブユニットと大サブユニットの結合を促進する。
:図1 16S rRNAの構造
さらに、16S rRNAの立体構造は、4つのドメインから構成されている。
また、16S rRNAの3′末端にはアンチシャインダルガーノ配列があり、リボソームで翻訳されるmRNAのシャインダルガーノ配列と結合することができる。
一般にmRNA上では、この配列は開始コドンであるAUGの8塩基上流付近に存在する。
一方、16S rRNAはリボソームのAサイトにおいて、コドンとアンチコドンの対合を安定化させる役割を担っている。
16S rDNAとは
16S rDNAは、原核生物の16S rRNAをコードする遺伝子です。
しかし、原核生物の機能的に関連する遺伝子の多くはオペロンに組織化されているため、16S rDNAもリボソーム合成を担う他の2つの遺伝子とともにオペロンに存在する。
基本的には、これらの他の遺伝子は23S rDNAと5S rDNAの遺伝子です。
一方、16S rDNAは1つの細菌のゲノムに2つ以上存在することもあります。
:図2 ファイトプラズマrRNAオペロン
さらに、16S rDNAは異なる原核生物間で保存されたDNA配列です。
そのため、16S rDNAの配列が著しく類似している原核生物は、系統的に類似していると言えます。
このような原核生物のDNA配列を比較することで、原核生物の進化的な関連性を解釈することができます。
また、原核生物の臨床的な同定も可能である。
16S rRNAと16S rDNAの類似性
- 16S rRNAと16S rDNAは、原核生物に存在する2つの塩基配列です。
- 原核生物のmRNAが翻訳される際に重要な役割を果たす。
16S rRNAと16S rDNAの違い
定義
16S rRNAは原核生物のリボソームの小サブユニット(30S)の構成要素であり、16S rDNAは原核生物の16S rRNAをコードする遺伝子のことである。
ヌクレオチドの種類
また、16S rRNAはRNA、16S rDNAはDNAのヌクレオチドから構成されている。
構造
16S rRNAが4つのドメインからなるのに対し、16S rDNAは23S、5S rRNA遺伝子とともにオペロンで構成されている。
機能
16S rRNAは、mRNA上のShine-Dalgarno配列に結合して翻訳される役割を果たし、16S rDNAは転写を受けてその遺伝子産物である16S rRNAを産生する。
有意性
さらに、16S rRNAは23S rRNAサブユニットと相互作用することで小サブユニットと大サブユニットの結合を促進し、16S rDNA配列は原核生物の同定に重要であることがわかった。
結論
16S rRNAは、原核生物リボソームの小サブユニットを構成するrRNAの一種である。
原核生物のリボソームの大サブユニットと結合する構造的な役割を持つ。
また、翻訳されるmRNA上のShine-Dalgarno配列と結合し、翻訳を開始させる。
一方、16S rDNAは、ゲノム中の遺伝子配列で、16S rRNAをコードしている。
一般に、この遺伝子は23S rRNAや5S rRNA遺伝子と同じオペロンで協同して発生する。
また、原核生物のゲノム中には、同じ遺伝子配列が複数個存在することもあります。
したがって、16S rRNAと16S rDNAの主な違いは、その機能です。