dNTPとddNTPの主な違いは、dNTPがデオキシリボース糖からなるのに対して、ddNTPはジデオキシリボース糖からなることである。
簡単に説明すると、dNTPとddNTPは、DNA分子の基本的な構成要素であるヌクレオチドです。
DNAのヌクレオチドは、デオキシリボース糖、窒素塩基、リン酸基から構成されている。
さらに、ヌクレオチドはホスホジエステル結合を形成してDNAを形成する。
そして、DNAは二本鎖の分子であり、生物の遺伝情報を運ぶことが主な役割です。
dNTPとは
dNTP（デオキシリボヌクレオチド）とは、デオキシリボースを糖分子として含むヌクレオチドのことである。
このヌクレオチドをDNAヌクレオチドと呼びます。
また、dNTPには、dATP、dGTP、dGTP、dTTPの4種類があります。
それぞれの機能を見ると、dNTPはDNAの前駆体分子であることがわかります。
DNAヌクレオチドの主な機能は、DNAを通じて遺伝情報を世代を超えて伝達することです。
図1: DNA
さらに、dNTPの構成要素は、デオキシリボース糖、窒素塩基、リン酸基の3つです。
デオキシリボース糖には、3’OH基が含まれている。
窒素塩基には、プリン塩基とピリミジン塩基のいずれかが含まれる。
さらに、窒素塩基は、DNA合成時に水素結合を形成して塩基対を形成する。
DNA合成の際、3’OH基は2番目のデオキシリボースヌクレオチドの4’炭素にあるリン酸基とホスホジエステル結合を形成する。
ddNTPsとは
ddNTPは、サンガーシーケンスの鎖切断反応に重要なヌクレオチドの一種です。
ddNTPの主な特徴は、ジデオキシリボース糖基を含んでいることです。
また、3’OH基を含まない。
その他、ddNTPは1’炭素原子に窒素塩基、4’炭素原子にリン酸基を持つことはdNTPと同じです。
図2: ddNTP
また、サンガーシークエンスは、標的DNAを増幅し、その配列を詳細に調べる方法です。
この方法では、dNTPとddNTPを混合して配列決定に用います。
DNAの鎖が長くなり始めると、ddNTPがランダムに鎖に組み込まれる。
しかし、ddNTPは3’OH基を持たないため、次のヌクレオチドを付加するためのホスホジエステル結合を形成できず、鎖の成長が止まってしまう。
このため、ddNTPは「鎖終結ヌクレオチド」とも呼ばれる。
ddNTPは、ddATP、ddGTP、ddCTP、ddTTPの4種類です。
これらのヌクレオチドは、配列決定法において、容易に検出できるように蛍光標識されている。
dNTPとddNTPの類似性
- dNTPとddNTPは、構造も機能も異なる2種類のヌクレオチドです。
- 糖、窒素塩基、リン酸基の3つがヌクレオチドを構成しています。また、ヌクレオチドはホスホジエステル結合を形成してDNAを形成する。
dNTPとddNTPの違い
定義
dNTPとはデオキシリボヌクレオチド三リン酸のことで、各dNTPはリン酸基、デオキシリボース糖、窒素塩基からなる。
一方、ddNTPはジデオキシヌクレオチド三リン酸を指し、サンガーディオキシ法でDNAの異なる長さのDNA鎖を生成するために使用するものです。
機能
また、dNTPはDNAの構成要素であり、ddNTPはサンガーシーケンサー法で使用されるヌクレオチドです。
構造
また、dNTPはデオキシリボース糖に3’OH基を持つが、ddNTPはジデオキシリボース糖に3’OH基を持っていない。
ホスホジエステル結合
dNTPはホスホジエステル結合を形成できるのに対し、ddNTPはホスホジエステル結合を形成できない。
DNA合成
さらに、dNTPはDNA合成を継続し、ddNTPはDNA合成を終了させる。
使用方法
また、dNTPはDNA合成に、ddNTPはサンガーシーケンサー法の鎖切断反応に重要です。
結論
簡単に説明すると、dNTPは3’OH基を持つデオキシリボヌクレオチドです。
dNTPの構成要素は、デオキシリボース糖、窒素塩基、リン酸基の3つです。
dNTPの主な機能は、DNA合成に関与することである。
一方、ddNTPは、糖の中に3’OH基を持たないジデオキシリボヌクレオチドを含んでいる。
また、ddNTPの主な機能は、サンガーシークエンスにおける鎖切断法に関与することである。
このように、dNTPとddNTPの主な違いは、その構造と機能です。
