ジェノタイピングとシーケンシングの大きな違いは、ジェノタイピングが個体のDNA配列を決定することによって遺伝子の構成を決定するプロセスであるのに対し、シーケンシングは核酸配列を決定するプロセスであることです。
ジェノタイピングとシーケンシングは、個体のDNA配列に関わる2つの技法です。
両手法とも、個体のDNA配列の変化を判定します。
ジェノタイピングとは
ジェノタイピングとは、個体の様々な遺伝子型を決定することです。
したがって、この技術は、個体間のDNA配列の違いを決定するものです。
遺伝子型を決定することにより、両親から受け継いだ個体の対立遺伝子を明らかにすることができます。
一般に、個体の遺伝子型は、個体のゲノムの特定の位置のDNA配列です。
遺伝子型の集まりが、個体の特徴を決定する。
また、個体によって遺伝子型は異なる。
図1: SNPジェノタイピング
さらに、DNA配列の変異を同定するための実験手順をジェノタイピングという。
一般的には、制限酵素多型（RFLP）、ランダム増幅多型検出法（RAPD）、増幅断片長多型（AFLP）、DNAシークエンス、PCR、対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドプローブ、DNAマイクロアレイ、ハイブリダイゼーションなどの方法があります。
シーケンスとは
DNA配列決定とは、特定のDNA断片の核酸配列を決定することです。
一般に、より迅速なDNA塩基配列決定法は1977年にFrederick Sangerによって開発されたのが最初です。
この方法は、「鎖終結阻害剤を用いたDNA塩基配列決定法」とも呼ばれていました。
しかし、もう一つのDNA塩基配列決定法は、1973年にWalter GilbertとAllan Maxamによって開発されました。
この方法は「化学的分解によるDNA塩基配列決定法」として知られていた。
一般に、どちらの方法も第一世代のDNA塩基配列決定法として認識されていた。
図2: シーケンス
さらに、1990年代半ばから後半にかけて、「次世代シーケンシング法」あるいは「第2世代シーケンシング法」と呼ばれるハイスループットなシーケンシング法が開発された。
これらは、シーケンシングの自動化により「大規模並列」シーケンシングを可能にした。
さらに、ゲノム全体の塩基配列を一度に決定することができるようになった。
ジェノタイピングとシーケンシングの類似性
- 遺伝子型解析と塩基配列解析は、特定の個体のDNA配列を扱う技術です。
- また、DNA配列とは、DNAの一部分の核酸配列のことです。
ジェノタイピングとシーケンシングの違い
定義
ジェノタイピングとは、生殖細胞系列のDNAを解析し、特定の変異が存在するかどうかを判定するプロセスを指し、シーケンシングとは、核酸配列（DNA中の塩基の順序）を決定するプロセスを指します。
有意性
ジェノタイピングは個体のDNA配列の違いを判定し、シーケンシングは生物のDNA配列を判定する。
技術情報
ジェノタイピングの主な手法には、RFLP、PCR、DNAシークエンスなどがあり、シークエンスの主な手法にはPCR増幅などがあります。
シークエンスバリアント
ジェノタイピングは既知の配列バリアントを検索し、シーケンシングは既知と未知のバリアントの両方を検索します。
取得データ量
また、ジェノタイピングはデータ量が少なく、シーケンシングはデータ量が多い。
重要性
ジェノタイピングは集団ベースの研究、複雑な多因子疾患の研究に重要であり、シーケンシングは疾患の診断、変異、エクソーム研究に重要です。
コスト
ジェノタイピングは安価であるが、シーケンシングは高価です。
例
ジェノタイピングの例としては、FISH、DNAマイクロアレイ、SNPアレイなどがあり、シーケンシングの例としては、サンガーシーケンシング、エクソームシーケンシングなどがあります。
結論
簡単に説明すると、遺伝子型解析と塩基配列解析は、ある特定の個体のDNA配列を扱う技術です。
ジェノタイピングでは、個体間の遺伝子型の違いを決定し、シーケンシングでは、生物のDNA配列を決定する。
ジェノタイピングは集団ベースの研究や病気の判定に重要であり、シーケンシングは病気や突然変異の診断に重要です。
したがって、ジェノタイピングとシーケンシングの大きな違いは、それぞれの手法の重要性です。
