エクソームとトランスクリプトームの主な違いは、エクソームがゲノム中のタンパク質コード遺伝子の全エキソン配列であるのに対し、トランスクリプトームはタンパク質コード遺伝子に由来するメッセンジャーRNA分子の集合体である点です。
さらに、エクソームはゲノム配列全体の1～2%を占め、トランスクリプトームは細胞内の全RNAの4%未満を占めるという。
エクソームとトランスクリプトームは、ゲノム中のタンパク質コード遺伝子の配列の集合体です。
両者は、ゲノム研究や疾患診断など様々な用途に利用されている。
主な対象分野
- エクソームとは
– 定義、事実、技術 - トランスクリプトームとは
– 定義、事実、技術 - エクソームとトランスクリプトームの類似点とは？
– 共通点の概要 - エクソームとトランスクリプトームの違いとは？
– 主な違いの比較
この記事の重要な単語
エクソン、エクソーム、mRNA、タンパク質コード化遺伝子、トランスクリプトーム
エクソームとは
エクソームとは、特定の生物のゲノムのうち、タンパク質をコードする遺伝子のエクソンの集合体のことである。
ゲノムのコード配列は、タンパク質またはRNAをコードする遺伝子に集積されている。
原核生物ゲノムでは、コーディング配列は他の配列によって中断されていないが、真核生物ゲノムでは、遺伝子のコーディング配列はイントロンと呼ばれる非コード化配列によって中断されている。
そのため、コーディング配列が集まったものをエクソンと呼ぶ。
タンパク質をコードする遺伝子では、RNAポリメラーゼが転写の際に、エクソンだけでなくイントロンも前駆体mRNAに転写する。
組み込まれたイントロンは、次の転写後修飾の際に除去される。
エクソーム研究に用いられる主な技術は、全エクソームシーケンス（WES）です。
WESは、特定のゲノムの断片化したDNAをハイブリダイゼーションして、標的DNA配列を特定し、その後、塩基配列を決定するものです。
トランスクリプトームとは
トランスクリプトームとは、細胞内で発現しているmRNAの総体です。
細胞の全RNAの4％未満を占める。
トランスクリプトームはプロテオームの構成を特定するため、その特定の細胞の生化学的能力を決定する。
また、特定の細胞のトランスクリプトームは合成することができず、細胞分裂の際に必ず親細胞から娘細胞にやってくる。
そのため、RNAを生成する転写は、トランスクリプトームを維持するためのステップとなります。
：図2 多能性細胞のトランスクリプトーム
一方、細胞はその種の転写産物全体の情報を持っていますが、細胞内で発現する遺伝子は環境要因にも依存します。
トランスクリプトームの研究には、主にマイクロアレイとRNA-seqの2つの技術が用いられています。
エクソームとトランスクリプトームの類似性
- エクソームとトランスクリプトームは、ゲノムの中にある2つの塩基配列のセットです。
- どちらもタンパク質をコードする遺伝子の情報に関連している。
- エクソンで構成されている。
エクソームとトランスクリプトームの違い
定義
エクソームとは、ゲノムのうち、タンパク質合成のための情報をコードするエクソンからなる部分を指し、トランスクリプトームとは、生物の遺伝子に発現するすべてのメッセンジャーRNA分子の総和を指す。
この定義から、エクソームとトランスクリプトームの主な違いは一目瞭然です。
意義
したがって、エクソームはタンパク質をコードする遺伝子のエクソンの総セットであり、トランスクリプトームは細胞内で発現しているmRNAの総セットです。
DNAまたはRNA
また、エクソームはDNAで構成され、トランスクリプトームはRNAで構成される。
金額
エクソームは全ゲノムの1-2%を占め、トランスクリプトームは細胞の全RNAの4%未満を占める。
レベル
エキソームとトランスクリプトームのもう一つの違いは、エキソームがゲノムレベルであるのに対して、トランスクリプトームは転写レベルであることである。
技術情報
さらに、マイクロアレイやRNA-seqがトランスクリプトームを決定するのに対し、全エキソームシーケンスはエクソームを決定する手法です。
結論
エクソームとは、ゲノムのWESによって決定されたゲノム中のエクソンの全セットのことである。
従って、エクソームはDNAベースの概念です。
しかし、トランスクリプトームは、細胞のmRNAの全集合であるため、RNAベースの概念です。
エキソームとトランスクリプトームの大きな違いは、その概念にある。
