例
トリソミー。
ヒトのダウン症はトリソミーの一例です。
3倍体。
3n個の核は3倍体の例です。
VNTRとは
VNTRとは、タンデムリピートの一種で、短い塩基配列(10-60塩基対)が特定の遺伝子座で可変回数繰り返されるものを指します。
したがって、VNTRはミニサテライトとも呼ばれる。
VNTRは真核生物のゲノムの染色体中に散在している。
一般に、VNTRの繰り返し単位数は個体によって異なる。
したがって、VNTRが形成する配列の長さも個体によって異なる。
染色体の変異数は親から受け継がれるため、親子鑑定や個人鑑定に利用することができます。
図1に、6人のVNTRの変異を示します。
VNTRは、DNAプロファイリングにおいて、特定の人物のDNAの特徴を決定するために用いられる最初の多型です。
また、PCR、ゲル電気泳動、サザンブロッティングによるバンドパターンの作製を行うRFLP(制限断片長多型)においても、遺伝子マーカーとして利用されている。
STRとは
STRとは、タンデムリピートの一種で、ある遺伝子座に短い塩基配列(2-6塩基対)が可変回数繰り返されるものをいう。
STRはマイクロサテライトの一種であり、植物遺伝学ではショートシーケンスリピート(SSR)とも呼ばれる。
一塩基からなる繰り返し単位は一塩基多型(SNP)と呼ばれる。
STRは、現在、法医学遺伝学で分析されている最も一般的な遺伝子多型の一種である。
STRを遺伝子マーカーとしたDNAプロファイリングを図2に示します。
図2:DNAプロファイリング
STRの一部の領域に変異があると、脆弱X症候群やハンチントン病などの遺伝病が引き起こされる。
Sim
Sim
定義
VNTR: VNTRはタンデムリピートの一種で、短い塩基配列(10-60塩基対)が特定の遺伝子座で可変回数繰り返される。
STR:STRはタンデムリピートの一種で、短い塩基配列(2-6塩基対)が特定の遺伝子座で可変回数繰り返される。
VNTRとSTRの類似性
- VNTRとSTRは2種類のタンデムリピートです。
- VNTRとSTRは共に真核生物ゲノムの構造領域です。
- VNTRとSTRは共に非コードDNAです。
- VNTRとSTRは共に親から遺伝する。
- VNTR、STRともに反復配列からなり、互いに隣接して配列している。
- VNTR、STRともに遺伝的多型が生じる。
- VNTRとSTRは共にゲノム中に分布している。
- VNTRもSTRも法医遺伝学の遺伝子マーカーとして使用されている。
- VNTRとSTRの両方が変異すると、遺伝性疾患につながる。
繰り返しDNAの種類
VNTR: VNTRはミニサテライトDNAの一種である。
STR: STRはマイクロサテライトDNAの一種です。
繰り返し回数
VNTR: VNTRは10〜1,500回の配列で構成されています。
STR:STRは5〜200回の配列で構成される。
アレイの大きさ
VNTR: VNTRは0.5-15kbのアレイを形成する。
STR:STRは10-1000bpのアレイを形成する。