マイクロサテライトとミニサテライトの主な違いは、マイクロサテライトの繰り返し単位が2-6塩基対であるのに対し、ミニサテライトの繰り返し単位は10-100塩基対であることである。
また、マイクロサテライトは5～200回、ミニサテライトは10～1,500回の繰り返し配列です。
マイクロサテライトとミニサテライトは、ゲノム中に存在する2種類の反復性DNAです。
マイクロサテライトの主な用途はDNAフィンガープリントであり、ミニサテライトの用途は家族集団に存在することから父子鑑定です。
マイクロサテライトとは
マイクロサテライトとは、ゲノム上に存在する2〜6塩基対の繰り返し配列のことです。
塩基配列の短いタンデムリピートの一種であるため、マイクロサテライトはショートタンデムリピート（STR）とも呼ばれる。
また、一塩基の繰り返しを一塩基多型(SNP)と呼びます。
さらに、マイクロサテライトはゲノムの至る所に存在する。
ヒトゲノムでは、ジヌクレオチド反復配列は3万塩基対に1つ存在する。
：図1 父子鑑定
さらに、マイクロサテライトは、ゲノムの中でも変異が多い領域です。
変異を獲得する主な方法は、複製中のDNAスリップです。
家族内でもユニークなマイクロサテライト配列が発生します。
そのため、マイクロサテライトの解析を父子鑑定に利用している。
さらに、3塩基マイクロサテライトリピートの伸長により、脆弱X症候群やハンチントン病など、ヒトの重篤な疾患が引き起こされる。
超小型衛星とは？
ミニサテライトとは、ゲノム中に存在する10〜100塩基対の繰り返し配列のことである。
ここでは、繰り返し単位がある程度大きく、DNAモチーフと呼ばれる。
ミニサテライトの別名は、可変長タンデムリピート（VNTR）です。
VNTRの数は個体間で大きく変動する。
ミニサテライトの繰り返し単位はGCリッチです。
図2: ミニサテライト
ミニサテライトは個人差が大きいため、DNAのフィンガープリンティングに利用されています。
また、連鎖解析の際の遺伝マーカーとしても利用される。
ミニサテライトの中には、Ras癌遺伝子に関連した癌の形成に関与するものもあります。
マイクロサテライト・ミニサテライトの共通点
- マイクロサテライトとミニサテライトは、真核生物のゲノムに存在するタンデムリピートと呼ばれる反復性の高いDNAの一種です。
- マイクロサテライトとミニサテライトは、真核生物のゲノムに存在するタンデムリピートからなる高度な反復性DNAで、ゲノム上で指定された機能はありませんが、ゲノムの構造を維持するために重要な役割を担っています。
- また、遺伝子間領域には存在しない。また、これらのDNA配列は遺伝子間領域に存在しないため、ノンコーディングDNAと呼ばれる。
- さらに、どちらも個体識別に利用することができる。
- また、これらのDNA配列はいずれも個体識別に用いることができます。
- CsCl密度勾配分析において、小さく暗いバンドとして現れる。
マイクロサテライト・ミニサテライトの違いについて
定義
マイクロサテライトとは、染色体上の特定の遺伝子座に存在する短い反復配列で、個体によってその数が異なるため、遺伝的指紋として利用できるものを指し、ミニサテライトとは、100塩基程度までの反復単位で、可変数のタンデムリピートからなる多型DNAを指します。
これがマイクロサテライトとミニサテライトの基本的な違いです。
タンデムリピートの種類
マイクロサテライトはSTR、ミニサテライトはVNTR。
発生状況
また、マイクロサテライトは主にゲノム全域に、ミニサテライトは主にゲノムの末端に存在する。
繰り返し単位の大きさ
マイクロサテライトの繰り返し単位の大きさは2〜6塩基対であるのに対し、ミニサテライトの繰り返し単位の大きさは10〜100塩基対です。
この点がマイクロサテライトとミニサテライトの大きな違いです。
ゲノムあたりのリピート数
マイクロサテライトではゲノム中に5〜200回程度、ミニサテライトでは10〜1,500回程度、特定の繰り返し単位が発生する。
アレイの大きさ
マイクロサテライトとミニサテライトのもう一つの違いは、繰り返し単位の配列の大きさが、マイクロサテライトでは0.5-15kbであるのに対し、マイクロサテライトでは10-1,000塩基対であることである。
配列の複雑さ
マイクロサテライトの配列は主にホモジニアスであり、ミニサテライトの配列はヘテロジニアスです。
結論
マイクロサテライトは真核生物ゲノムに存在する反復配列DNAの一種で、2-6塩基対の長さの反復配列である。
ゲノム中に広く存在し、父子鑑定に利用できる。
一方、ミニサテライトは、10-100塩基対の長さの反復配列を持つ反復DNAの一種である。
主に染色体の末端に存在し、DNA指紋に利用することができる。
このように、マイクロサテライトとミニサテライトの主な違いは、その構造と重要性です。
