sgRNAはシングルガイドRNA、gRNAを表す用語であるのに対し、gRNAはガイドRNA、CRISPRシステムによるゲノム編集でエンドヌクレアーゼに特定の標的を指定するために用いられるRNA分子です。
したがって、sgRNAもgRNAも同じ分子を表すのに使われる互換性のある言葉です。
sgRNAとgRNAの間に大きな違いはありません。
sgRNAもgRNAも合成分子であり、機能的にはCRISPRシステムにおけるcrRNAに類似している。
sgRNAとは
sgRNA (Single Guide RNA) は、gRNA の別称です。
図 1: sgRNA の概要
gRNAとは
gRNA（ガイドRNA）とは、ゲノム改変ツールの中でも特異性の高いCRISPRシステムによるゲノム編集に用いられる短い合成RNA分子のことで、ゲノムの標的DNA配列に結合する約20bpの塩基配列で構成されています。
この配列はスペーサー配列と呼ばれる。
gRNA分子は、エンドヌクレアーゼであるCasが結合するための足場配列で構成されている。
つまり、CRISPRを用いたゲノム編集の構成要素は、gRNAとCRISPRに付随するエンドヌクレアーゼ（Cas）の2つです。
一方、CRISPRシステムのターゲットとなるゲノムは、gRNAの配列によって変化する。
gRNAは、合成方法によって3種類存在する。
合成crRNA、レンチウイルスsgRNA、合成sgRNAです。
sgRNAとgRNAの類似性
- sgRNAとgRNAは、CRISPRシステムを用いたゲノム編集ツールにおいて、エンドヌクレアーゼに標的配列を指定するために用いられる低分子RNAです。
- どちらもDNAとハイブリダイズする20bpの領域を持っています。
- どちらも人工分子であり、自然界には存在しない。
- どちらも自然界のCRISPRシステムでcrRNAが担っている機能と同じです。
sgRNAとgRNAの違いについて
定義
sgRNA (single guide RNA) は人工 CRISPR システムで用いられる gRNA を指し、gRNA (guide RNA) は CRISPR によるゲノム編集の標的配列を特定する短い合成 RNA 配列を指します。
- sgRNAとgRNAは同じ分子を表す用語として使用されます。
結論
sgRNAはgRNAの別称であり、gRNAはCRISPRシステムにおいてエンドヌクレアーゼがゲノム中の標的配列を特定するために用いられる短い合成RNA配列です。
sgRNAもgRNAもCRISPRを用いたゲノム編集の構成要素の一つです。
したがって、sgRNAとgRNAの主な違いは、用語の違いだけです。
