フォワードプライマーとリバースプライマーの大きな違いは、フォワードプライマーが二本鎖DNAのアンチセンス鎖（3′から5′方向）にアニールするのに対して、リバースプライマーは二本鎖DNAのセンス鎖（5′から3′方向）にアニールする点です。
なお、5′プライマーはフォワードプライマー、3′プライマーはリバースプライマーと呼ばれる。
フォワードプライマーとリバースプライマーは、DNA鎖の特定部分を増幅するPCR（ポリメラーゼ連鎖反応）で使用される2種類のプライマーであり、フォワードプライマーとリバースプライマーは、DNA鎖の特定部分を増幅するPCRで使用されるプライマーです。
主な対象分野
- フォワードプライマーとは
– 定義、特徴、重要性 - リバースプライマーとは
– 定義、特徴、重要性 - フォワードプライマーとリバースプライマーの類似点とは
– 共通する特徴の概要 - フォワードプライマーとリバースプライマーの違いについて
– 主な違いの比較
Key Terms
3′プライマー、5′プライマー、アンチセンス鎖、フォワードプライマー、PCR、リバースプライマー、センス鎖
フォワードプライマーとは
フォワードプライマーとは、PCRのセットアップで使用される2種類のプライマーのうちの1つです。
フォワードプライマーの最大の特徴は、二本鎖DNAのアンチセンスまたは(-)鎖にアニールすることである。
一般に、アンチセンス鎖はmRNAを合成する際の鋳型鎖として機能する。
したがって、この鎖はコーディング鎖とも呼ばれる。
図1：プライマーのアニーリング
しかし、フォワードプライマーの主な機能は、PCRの際にアンチセンス鎖を増幅することである。
リバースプライマーとは
リバースプライマーはPCRのセットアップで使われる2番目のタイプのプライマーです。
二本鎖DNAのセンス鎖または(+)鎖にアニールする。
センス鎖は鋳型鎖と相補的であるため、アンチコード鎖と呼ばれる。
さらに、リバースプライマーの主な機能は、PCRの際にセンス鎖を増幅することである。
フォワードプライマーとリバースプライマーの類似性
- フォワードプライマーとリバースプライマーは、PCRに有用な2種類のプライマーです。
- どちらもPCRの開始時に使用されるオリゴヌクレオチドです。
- また、長さは18から25塩基対の間です。
- また、長さは18塩基対から25塩基対です。
- また、相補的なDNAであり、アニーリングステップで一本鎖DNAにアニーリングする。
- さらに、これらのアニーリングはより高い温度で起こり、その融解温度（Tm）は55℃と65℃の間にあることが望ましい。
- 両プライマーの融解温度の差は最大でも5℃であることが重要です。
- また、GC含量は40〜60％で、プライマーの3′末端は結合を促進するためにCまたはGでなければならない。
- 二次構造を形成する領域が含まれていないこと。
- さらに、自己二量体・ヘアピン、プライマー二量体形成は避ける。
フォワードプライマーとリバースプライマーの違い
定義
フォワードプライマーとは、二本鎖DNAのアンチセンス鎖に相補的なPCRプライマーのことであり、リバースプライマーとは、二本鎖DNAのセンス鎖に相補的なPCRプライマーのことである。
したがって、これがフォワードプライマーとリバースプライマーの大きな違いです。
また、次のように知られています。
5′プライマーはフォワードプライマー、3′プライマーはリバースプライマーを指します。
機能
フォワードプライマーはアンチセンス鎖の増幅を、リバースプライマーはセンス鎖の増幅を担当し、また、フォワードプライマーはアンチセンス鎖の増幅を、リバースプライマーはセンス鎖の増幅を担当する。
発生状況
また、フォワードプライマーとリバースプライマーのもう一つの違いは、フォワードプライマーはPCR産物の5′末端に発生し、リバースプライマーはPCR産物の3′末端に発生することである。
結論
Forwardプライマーは、PCRで使用される2つのプライマーのうちの1つです。
また、DNAのアンチセンス鎖にアニールする。
一方、リバースプライマーは、PCRで使用される2つ目のタイプのプライマーです。
これらはDNAのセンス鎖にアニールする。
その主な役割は、特定のDNAを増幅することである。
しかし、フォワードプライマーとリバースプライマーの主な違いは、アニーリングするDNA鎖の種類です。
