フォワードプライマーとリバースプライマーの違いとは?分かりやすく解説!

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フォワードプライマーとリバースプライマーの大きな違いは、フォワードプライマーが二本鎖DNAのアンチセンス鎖(3′から5′方向)にアニールするのに対して、リバースプライマーは二本鎖DNAのセンス鎖(5′から3′方向)にアニールする点です。

なお、5′プライマーはフォワードプライマー、3′プライマーはリバースプライマーと呼ばれる。

フォワードプライマーとリバースプライマーは、DNA鎖の特定部分を増幅するPCR(ポリメラーゼ連鎖反応)で使用される2種類のプライマーであり、フォワードプライマーとリバースプライマーは、DNA鎖の特定部分を増幅するPCRで使用されるプライマーです。

主な対象分野

  1. フォワードプライマーとは
         – 定義、特徴、重要性
  2. リバースプライマーとは
         – 定義、特徴、重要性
  3. フォワードプライマーとリバースプライマーの類似点とは
         – 共通する特徴の概要
  4. フォワードプライマーとリバースプライマーの違いについて
         – 主な違いの比較

Key Terms

3′プライマー、5′プライマー、アンチセンス鎖、フォワードプライマー、PCR、リバースプライマー、センス鎖

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フォワードプライマーとは

フォワードプライマーとは、PCRのセットアップで使用される2種類のプライマーのうちの1つです。

フォワードプライマーの最大の特徴は、二本鎖DNAのアンチセンスまたは(-)鎖にアニールすることである

一般に、アンチセンス鎖はmRNAを合成する際の鋳型鎖として機能する。

したがって、この鎖はコーディング鎖とも呼ばれる。

Forward vs Reverse Primers 図1:プライマーのアニーリング

しかし、フォワードプライマーの主な機能は、PCRの際にアンチセンス鎖を増幅することである

リバースプライマーとは

リバースプライマーはPCRのセットアップで使われる2番目のタイプのプライマーです。

二本鎖DNAのセンス鎖または(+)鎖にアニールする。

センス鎖は鋳型鎖と相補的であるため、アンチコード鎖と呼ばれる。

さらに、リバースプライマーの主な機能は、PCRの際にセンス鎖を増幅することである

フォワードプライマーとリバースプライマーの類似性

  • フォワードプライマーとリバースプライマーは、PCRに有用な2種類のプライマーです。
  • どちらもPCRの開始時に使用されるオリゴヌクレオチドです。
  • また、長さは18から25塩基対の間です。
  • また、長さは18塩基対から25塩基対です。
  • また、相補的なDNAであり、アニーリングステップで一本鎖DNAにアニーリングする。
  • さらに、これらのアニーリングはより高い温度で起こり、その融解温度(Tm)は55℃と65℃の間にあることが望ましい。
  • 両プライマーの融解温度の差は最大でも5℃であることが重要です。
  • また、GC含量は40〜60%で、プライマーの3′末端は結合を促進するためにCまたはGでなければならない。
  • 二次構造を形成する領域が含まれていないこと。
  • さらに、自己二量体・ヘアピン、プライマー二量体形成は避ける。

フォワードプライマーとリバースプライマーの違い

定義

フォワードプライマーとは、二本鎖DNAのアンチセンス鎖に相補的なPCRプライマーのことであり、リバースプライマーとは、二本鎖DNAのセンス鎖に相補的なPCRプライマーのことである

したがって、これがフォワードプライマーとリバースプライマーの大きな違いです。

また、次のように知られています。

5′プライマーはフォワードプライマー、3′プライマーはリバースプライマーを指します。

機能

フォワードプライマーはアンチセンス鎖の増幅を、リバースプライマーはセンス鎖の増幅を担当し、また、フォワードプライマーはアンチセンス鎖の増幅を、リバースプライマーはセンス鎖の増幅を担当する。

発生状況

また、フォワードプライマーとリバースプライマーのもう一つの違いは、フォワードプライマーはPCR産物の5′末端に発生し、リバースプライマーはPCR産物の3′末端に発生することである

結論

Forwardプライマーは、PCRで使用される2つのプライマーのうちの1つです。

また、DNAのアンチセンス鎖にアニールする。

一方、リバースプライマーは、PCRで使用される2つ目のタイプのプライマーです。

これらはDNAのセンス鎖にアニールする。

その主な役割は、特定のDNAを増幅することである

しかし、フォワードプライマーとリバースプライマーの主な違いは、アニーリングするDNA鎖の種類です。

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