AFLPとRFLPの主な違いは、AFLPが制限酵素による消化と選択的増幅を行うのに対し、RFLPは制限酵素による消化とプローブによる検出を行う点です。
AFLPとRFLPは、相同なDNA配列の変異を利用したPCR技術です。
一般に、どちらも多型を検出する。
AFLPとは
AFLP（amplified fragment length polymorphism）とは、消化されたDNA断片を選択的に増幅し、ゲノムに固有のフィンガープリントを生成する方法です。
1990年代前半にKeyGene社によって発明された。
AFLPでは一般に、ゲノムDNAを制限酵素で細かく消化する。
次に、制限酵素の粘着性のある末端にアダプターを結合させる。
その後、アダプター配列と相補的なプライマーを用いて、制限酵素断片を選択的に増幅する。
図1: RFLPジェノタイピング
さらに、増幅された制限酵素断片をゲル電気泳動で分離し、可視化する。
AFLPの重要性は、ゲノムの様々な領域に存在する様々な多型を検出することができる点です。
さらに、AFLPは再現性のある高感度な手法です。
さらに重要なことは、AFLPはDNAフィンガープリンティングに用いられることである。
RFLPとは
RFLP（制限酵素断片長多型）は、ゲノムの多型領域の変異を同定する手法です。
1984年代にAlec Jeffreysによって発明された。
一般に、ほとんどの制限マーカーは共優性であり、ヘテロ接合である2つのアレルで発生する。
また、高い位置特異性があります。
図2：DNAフィンガープリンティング
さらに、RFLPは制限酵素によるゲノムの消化を伴います。
また、RFLPはゲノムを制限酵素で消化し、制限酵素の断片とプローブをハイブリダイズさせて多型のパターンを検出する。
さらに、特定の遺伝子座の遺伝子型を検出することができる。
一般に、RFLPはゲノムマッピングや、ジェノタイピング、父子鑑定、法医学などの変異解析に重要です。
AFLPとRFLPの類似性
- AFLPとRFLPは、相同染色体の変異を利用した2つの手法です。
- 一般に、どちらも細胞内の全DNAを1種類以上の制限酵素で消化する。
- 多型の検出には、AFLPとRFLPの両方が重要です。
AFLPとRFLPの違い
定義
AFLP（amplification fragment length polymorphism）とは、PCRを用いた手法で、消化されたDNA断片のサブセットを選択的に増幅し、目的のゲノムに固有のフィンガープリントを生成して比較するものです。
一方、RFLP（制限酵素断片長多型）は、相同なDNA配列の変異を利用して、個体、集団、種を区別したり、配列内の遺伝子の位置を特定したりする手法であり、DNA配列の変異を利用して、個体、集団、種を区別したり、配列内の遺伝子の位置を特定したりする。
発明品
AFLPは1990年代初頭にKeyGene社によって、RFLPは1984年代にAlec Jeffreys氏によって発明された。
検出
一般に、AFLPは選択的増幅によって多型を検出し、RFLPはプローブによって多型を検出する。
重要性
また、AFLPはDNAのフィンガープリントに、RFLPはゲノムマッピングや遺伝性疾患の局在診断に重要です。
結論
ゲノムの多型を検出するPCR技術として、AFLPとRFLPがあります。
一般に、AFLPは制限酵素で消化した後、選択的に増幅する。
一方、RFLPは制限酵素で増幅した後、プローブで検出する。
したがって、AFLPとRFLPの大きな違いは、検出方法です。
