根付き系統樹と非根付き系統樹の主な違いは、根付き系統樹は祖先の関係を示すのに対し、非根付き系統樹は生物の関連性だけを示すという点です。
また、根付き系統樹の子孫はそれぞれ直近の共通祖先を持つが、根付きでない系統樹は祖先の根を示さない。
全体として、根付き系統樹と非根付き系統樹は、生物間の関係を記述する2種類の系統樹です。
主な対象分野
- 根付き系統樹とは何か
– 定義、特徴、重要性 - 非根幹系統樹とは何か
– 定義、特徴、重要性 - 根元系統樹と非根元系統樹の類似点とは？
– 共通点の概要 - 根元系統樹と非根元系統樹の違いとは？
– 主な違いの比較
Key Terms
祖先、最近の共通祖先、関連性、根元系統樹、非根元系統樹
根源的な系統樹とは何か
根付き系統樹は、生物集団の祖先を記述する系統樹の一種である。
重要なのは、最近の共通祖先と呼ばれるユニークなノードから始まる有向木であることだ。
基本的に、系統樹の根は、この最近の共通祖先を記述している。
しかし、この最近の共通祖先は、系統樹を構築するのに使われた生物群からは余分で遠縁の生物です。
しかし、この共通祖先は、そのグループ内のすべての生物の親として機能している。
根付かない系統樹とは
非根拠型系統樹は、ある生物群の近縁性だけを記述する系統樹の一種です。
重要なのは、このタイプの系統樹の葉節点は近縁性だけを示し、祖先は示さないということである。
したがって、この系統樹は最近の共通祖先から始まるものではなく、根を持たない。
図2: 根を持たない系統樹
しかし、根を持つ系統樹と同じデータを使って、根を持たない系統樹を作ることもできる。
これは、根を省略して作成される。
根付き系統樹と根付きでない系統樹の類似性
- 根付き系統樹と根無し草系統樹は、生物間の関係を記述する2種類の系統樹です。
- また、どちらの系統樹も生物の関連性を知ることができる。
- さらに、両者とも葉ノードと内部ノードを持つ。
根付き系統樹と根付きでない系統樹の違い
定義
根付き系統樹とは、祖先の関係を示す系統樹のことで、非根付き系統樹とは、生物の近縁性だけを示す系統樹のことである。
したがって、これが根付き系統樹と非根付き系統樹の主な違いです。
コンポーネント
また、根付き系統樹は根、内部ノード、葉ノードを含み、根なし系統樹は葉ノードと内部ノードのみを含み、根は含まれない。
生物の種類
さらに、根を張った系統樹には近縁の生物と、根の部分に遠縁の生物が余分に含まれているが、根を張っていない系統樹には近縁の生物しか含まれていない。
共通祖先
また、根付きの系統樹と根付かない系統樹のもう一つの重要な違いは、共通の祖先です。
根付きの系統樹は、各下孫の根となる最近の共通祖先を示すが、根付かない系統樹は共通祖先を示さない。
進化系パス
また、根付き系統樹では各根からノードまでが進化経路を示すが、根なし系統樹では進化経路が特定されない。
生物または遺伝子の祖先の状態
根付きの系統樹では、生物または遺伝子の祖先の状態が下から末端の枝まで表示されるが、根付かない系統樹では祖先の状態が表示されない。
したがって、この点も根付き系統樹と根付きでない系統樹の違いと言える。
結論
基本的に、根付き系統樹は系統樹の一種であり、最近の共通祖先を記述する根を持つ。
また、根からノードに至るまでが進化の道筋を示す。
一方、根のない系統樹は、ある生物集団の近縁性だけを記述する系統樹の一種である。
そのため、最近の共通祖先や進化の道筋は存在しない。
したがって、根付き系統樹と非根付き系統樹の主な違いは、最近の共通祖先の有無です。
