プロテオミクスとトランスクリプトミクスの主な違いは、プロテオミクスが特定の生物によって生成されるタンパク質全体の研究であるのに対し、トランスクリプトミクスは特定の生物によって合成されるmRNAの全体の研究であることです。
プロテオミクスとトランスクリプトミクスは、特定の生物の遺伝子発現を研究する2つの分野です。
プロテオミクスとは
プロテオミクスとは、プロテオームを大規模に研究することです。
プロテオームとは、特定の生物や細胞が作り出すタンパク質の集合体のことである。
したがって、特定の種類の生物や細胞は、固有のプロテオームを持っています。
プロテオミクスの主な研究領域は以下の通りです。
- タンパク質の立体構造予測
- タンパク質が合成された場所と時間の検出
- タンパク質の生産速度、分解速度、定常状態の量。
- 翻訳後修飾などのタンパク質の修飾。
- 細胞内コンパートメント間のタンパク質の輸送。
- 代謝経路におけるタンパク質の関与。
- 図1: PDBで公開されているタンパク質構造の例
プロテオミクス研究では、質量分析計やゲル電気泳動法（DIGE）などのハイスループット技術が利用されています。
トランスクリプトミクスとは
トランスクリプトミクスとは、特定の生物または細胞のトランスクリプトームを研究することです。
トランスクリプトームとは、生物または細胞内のmRNAの全集合を指す。
しかし、RNA全体を指すこともあります。
トランスクリプトームは、生物または細胞が直面する環境条件によって変化します。
したがって、トランスクリプトームは、特定の条件下で定義された時間に発現するRNAの集合を反映しています。
トランスクリプトームには、発現プロファイリングとスライスバリアント解析の両方の調査が含まれます。
DNAマイクロアレイとRNA Seqは、トランスクリプトミクスに用いられる2つの主要な技術です。
図2: マイクロアレイとRNA Seq
プロテオミクスとトランスクリプトミクスの類似性
- プロテオミクスとトランスクリプトミクスは、特定の生物または細胞の遺伝子発現を研究する2つの分野です。
- プロテオミクスとトランスクリプトミクスは、どちらもハイスループット技術が使用されている。
プロテオミクスとトランスクリプトミクスの相違点
定義
プロテオミクスはプロテオームとその機能の研究、トランスクリプトミクスはトランスクリプトームとその機能の研究です。
研究の種類
プロテオミクスは発現しているタンパク質全体を研究し、トランスクリプトミクスは特定の生物で発現しているmRNA全体を研究する。
現象
タンパク質の立体構造や機能、タンパク質間相互作用を研究するプロテオミクスと、mRNAの配列構造、環境との相互作用、応用を研究するトランスクリプトミクスがあります。
技術情報
プロテオミクスには質量分析法と差動ゲル電気泳動法（DIGE）が、トランスクリプトミクスにはDNAマイクロアレイとRNA Seqが技術として含まれます。
重要地域
プロテオミクスでは、SWISS-2DPAGEなどのプロテオームデータベースの開発、コンピュータ支援ドラッグデザインのためのソフトウェア開発、トランスクリプトミクスでは、細胞分化、発がん、初期胚発生を制御する分子機構やシグナル伝達経路、医薬品や化学物質のリスク評価のためのバイオマーカー、個体間の系統関係の推測などが重要な分野です。
結論
プロテオミクスは特定の生物のタンパク質全体を研究するものであり、トランスクリプトミクスはその生物のmRNA全体を研究するものです。
したがって、プロテオミクスとトランスクリプトミクスの主な違いは、研究の種類にある。
