ゲル電気泳動とSDS PAGEの主な違いは、ゲル電気泳動がDNA、RNA、タンパク質の分離に用いられる手法であるのに対し、SDS PAGEは主にタンパク質の分離に用いられるゲル電気泳動の一種であることである。
一般に、SDS PAGEは通常のゲル電気泳動よりも高い分解能が得られます。
ゲル電気泳動とSDS PAGEは、バイオテクノロジーにおいて、電荷とサイズに基づいて高分子を分離するのに役立つ技術です。
通常、ゲル電気泳動ではアガロースゲルスタブを使用して分離を行うのに対し、SDS PAGEではポリアクリルアミドゲルスタブを使用します。
主な対象分野
- ゲル電気泳動法とは
– 定義、手順、重要性 - SDS PAGEとは
– 定義、手順、重要性 - ゲル電気泳動とSDS PAGEの類似点とは？
– 共通点の概要 - ゲル電気泳動とSDS PAGEの違いとは？
– 主な違いの比較
主要な用語 アガロース、DNA、ゲル電気泳動、ポリアクリルアミド、蛋白質、SDS PAGE
ゲル電気泳動法とは？
ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質などの高分子の断片を、そのサイズと電荷に基づいて分離する技術です。
ゲル電気泳動では、ゲルマトリックス上の電場の影響を受けて高分子が移動し、このゲルマトリックスには高分子が移動するための孔があります。
ゲル電気泳動は、PCR、RFLP、クローニング、DNAシークエンス、ブロッティング技術から得られたDNAを分析する一般的な技術です。
ナノ粒子もゲル電気泳動で分離することができる。
ゲル刺は、海藻由来のアガロースという多糖類から調製される。
アガロースゲルは、長鎖のアガロース分子がクモの巣のように連なったものです。
ビデオ1では、アガロースゲルの調製について説明しています。
DNAもRNAも単量体のヌクレオチドにリン酸基を持っています。
そのため、分子全体で同じように負の電荷を持っています。
そして、電界をかけると正極に向かって移動します。
移動の速さは核酸の大きさに依存する。
短い分子は孔を通過する速度が速く、大きい分子は時間がかかる。
SDS-PAGEとは
SDS PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis) は、荷電分子をサイズに基づいて分離するための分析技術です。
このプロセスでは、SDSを使用してタンパク質を変性させることにより分離します。
SDSは洗浄剤であるため、タンパク質の三次構造が破壊され、折りたたまれたタンパク質が直鎖状になってしまう。
また、その直鎖状のタンパク質分子を一様に負電荷でコーティングする。
SDS PAGEは、濃度の異なる2つのゲルから構成されている。
上層は試料を載せるスタッキングゲルと呼ばれ、下層はレゾルビングゲルと呼ばれます。
積層ゲルのポリアクリルアミド濃度は3.5～4％（孔径が大きい）で、タンパク質を1つのバンドに濃縮します。
一方、分離ゲルのポリアクリルアミド濃度は4-20%（孔径が小さい）であり、タンパク質の大きさによって分離する。
ビデオ2では、SDS PAGEの調製を紹介しています。
SDS PAGEでは、タンパク質を短時間で分離することができ、その後のウェスタンブロッティングなどの解析に役立ちます。
図2：SDS-PAGEのタンパク質バンド
SDS PAGEは通常のアガロースゲルに比べて解像度が高いため、5-500 bp程度の小さなDNA断片を分離するのに役立ちます。
ゲル電気泳動とSDS PAGEの類似点
- ゲル電気泳動と SDS PAGE は、高分子をその電荷とサイズに基づいて分離する技術です。
ゲル電気泳動とSDS PAGEは、電荷とサイズに基づいて高分子を分離する技術である * 両技術とも、高分子が移動する小さな孔のあるゲルスタブを使用する。 - 駆動力は、2つの電極間の電位差です。
ゲル電気泳動とSDS PAGEの違いについて
定義
ゲル電気泳動。
DNA、RNA、タンパク質などの高分子の断片を、そのサイズと電荷に基づいて分離するために使用される技術。
SDS PAGE。
荷電分子をサイズに基づいて分離するために使用される分析技法。
組成
ゲル電気泳動。
SDS PAGE。
ランコンフィギュレーション
ゲル電気泳動：ホリゾンタルラン
SDS PAGE。
キャスティング方法
ゲル電気泳動。
SDS PAGE。
ポアサイズ
ゲル電気泳動。
アガロース濃度が高いほど、ポアサイズは小さくなる。
SDS PAGE。
アクリルアミドとビスアクリルアミドの比率で細孔径が決まる。
濃縮度
ゲル電気泳動：0.5～2%程度
SDS PAGE: 6-15%
分離
ゲル電気泳動：50〜20,000bpの核酸
SDS PAGE: 5-250,000 Daのタンパク質
条件
ゲル電気泳動。
SDS PAGE。
準備
ゲル電気泳動。
SDS PAGE。
染色
ゲル電気泳動。
SDS PAGE。
結論
ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質などの高分子をそのサイズに基づいて分離する分析技術です。
SDS PAGEはゲル電気泳動の一種で、主に変性条件下でタンパク質を分離するために用いられる。
SDS PAGEは、通常のゲル電気泳動と比較して、高い分離能を有しています。
ゲル電気泳動とSDS PAGEの主な違いは、分離される高分子の種類とその手順です。
